民国三十七年(1948年),小南海镇境域属团石,莲塘,泽随,詹家4个乡。
1950年2月,属团石,箬塘,后周,詹家4个乡。
1956年2月,属团石,雅周2个乡。
1958年9月,属团石,箬塘,雅塘3个大队。
1960年2月,改属塔石,箬塘,雅塘3个管理。
1961年7月,属团石,箬塘,虎头山3个公社。
1983年7月,属龙游,塔石,团石3个。
1984年1月,分属团石,箬塘,虎头山3个乡。
1992年5月,团石,箬塘,虎头山3个乡合并设立小南海镇。